沉迷数码卡牌游戏的少年，意外让真实数码兽降临涩谷，但这次它们带着数字世界的致命病毒。
2045年，数码卡牌对战成为全球青少年最热门的电子竞技。14岁的天才玩家高柳健太在一次比赛中，用自创代码卡激活了一张未知卡片，一只受伤的野生数码兽“裂波兽”从屏幕裂缝中跌入涩谷街头。裂波兽体内携带一种“逻辑病毒”，会吞噬现实世界的网络数据，导致城市瘫痪。健太发现，自己的卡牌编辑器竟能临时创造“反病毒程序”帮助裂波兽战斗。同时，另外两名驯兽师——冷静的女黑客大神爱瑠和懦弱的富二代小山田太阳——也分别召唤了自己的数码兽。三个孩子必须合作，在东京的地下数据中心、废弃服务器农场和虚拟空间里，迎战来自数码世界的“清除者”军团。而裂波兽最终必须选择：返回数字世界被格式化，或留在现实世界成为病毒引爆者。
最硬核的数码宝贝重启，完全抛弃子供向，拥抱赛博朋克与数据伦理。战斗设计致敬黑客帝国，进化场面变成代码重组，燃到头皮发麻。对游戏成瘾、AI恐惧的探讨远超同类动画，成人观众也会沉迷。
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朝廷密探与青楼老板长相酷似，两人被迫互换身份，一个当花魁收集情报，一个入朝堂假装王爷。
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上一集牺牲卧底的弟弟为兄复仇，却发现自己染上了和哥哥一样的毒瘾。
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英军上尉沙普被派往印度，他发现最大的敌人不是法国人，而是东印度公司的腐败军官。
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一张巨额拆迁款存折凭空消失，让三代同堂的“幸福”家庭瞬间撕破脸皮。